Kapela Svetog Duha, danas smještena na groblju, treća je po redu crkva istoga titulara u Omišlju. Prva kapela Svetog Duha u omišaljskom polju spominje se već 1565. godine kao vlasništvo obitelji Antončić. Imala je i svoju ložu, koja je služila kao zaklon ljudima tijekom rada u polju, osobito u slučaju lošeg vremena.

Godine 1910., za vrijeme župnika Mihovila Mužine, stara je kapela porušena, a na njezinu je mjestu podignuta veća crkva u neogotičkom stilu. Iznad ulaznih vrata bio je uklesan natpis: Na čast Duhu Svetom s temelja zazida puk Omišaljski 1910. Oltarnu sliku silaska Duha Svetoga izradio je domaći slikar Franjo Pavačić.

Početkom 1914. godine uz kapelu je otvoreno novo groblje, čime je crkva dobila i funkciju grobne kapele. Zbog slijeganja terena, vjerojatno uzrokovanog blizinom ceste, zidovi su s vremenom popucali te je objekt postao nesiguran za korištenje.

Proširenjem groblja Svetog Duha 1961. godine sagrađena je nova kapela istog titulara. Godine 1991. postavljen je metalni križ prepoznatljive plave boje, simbol stradanja omišaljskih pomoraca. Uz groblje je krajem 2009. godine izgrađena mrtvačnica i uređen parkirni prostor. Danas je groblje Sveti Duh zajedničko groblje Omišlja i Njivica.